PREMIER system umožňuje pořízené vydané faktury ihned zaúčtovat, tzn. automaticky přenést do účetního deníku, resp. dokladové řady. Podmínkou automatizovaného zaúčtování faktury je zadání příslušného účtu (předkontace) u každé položky faktury na straně DAL, ale také je nutné mít vyplněný účet na straně MD (pohl. účet). Takto pořízená faktura automaticky vstoupí do deníku a je zaúčtována.
Pokud se byť jen u jedné položky účetní předpis nezadá, program při ukládání hlásí, že tato faktura nebude zaúčtována, nýbrž pouze evidována.
Tato faktura pak zůstává pouze v operativní evidenci, aniž by byla přenesena do deníku, tzn., že objem pohledávek (v knize pohledávek) je o částku této faktury vyšší než zůstatek na příslušném saldokontním účtu 311… v účetnictví.
Tyto rozdíly mohou vzniknout z více důvodů, proto pro sledování těchto rozdílů slouží funkce "Kontrola konzistence", která uživateli nabídne všechny nesrovnalosti v saldokontu faktur (tedy i kontinuitu). Tato funkce se nachází v záložce „Účetnictví - Daňová kancelář - DPH - kontrola konzistence VF, PF“, nebo v „Účetnictví - Deník - horní menu Deník – kontrola konzistence VF, PF“.
Nezaúčtované faktury lze později změnit (F4) a zaúčtovat tím způsobem, že jim bude dodatečně doplněna předkontace např. hlavním účetním.