Uživatelská příručka je rozdělena na základní kapitoly, které jsou členěny dle jednotlivých subsystémů programu, tedy záložek - kapitoly 2 - 10. Pouze kapitoly č.1, č.11, č12 popisují základní práci v programu nebo jeho rozšiřující možnosti či jeho systémové uspořádání a obecné funkce, které se nabízí v celém IS PREMIER.
Především kapitolu "1 - Obecné" je důležité prostudovat pro úspěšné zvládnutí další práce v programu
Kompletní nastavení programu se nachází v subsystému „SPRÁVCE“, kde jsou předvolby rozděleny podle systémového hlediska na Globální, Uživatelské a Omezující. Ostatní moduly jsou určeny především pro pořizování a sledování dat. Téměř veškerá základní účetní nastavení se nachází v modulu „Účetnictví-Osnova/Doklady“ a dále již následují kapitoly subsystémů, které slouží k pořizování prvotních dokladů. V úvodu každé kapitoly jsou popsány základní funkce a nastavení subsystému; poté jsou již kapitoly členěny dle jednotlivých modulů (např. „Účetnictví-Deník“)
Všechny kapitoly kromě kapitoly „Účetnictví“ jsou společné pro daňovou evidenci (bývalé jednoduché účetnictví) a účetnictví (bývalé podvojné účetnictví). Některá témata, např. o účtování faktur, mezd či skladu, jsou tedy určeny pouze pro účetnictví. V případě účetního předpisu u faktur se v daňové evidenci používá kód účetní operace.
Ve všech hlavních kapitolách je vždy ještě také "Obsah".